北京基因组研究所（国家生物信息中心）发明哺乳动物细胞热刺激反应中染色质空间构象改变的新诠释
热刺激是细胞最经常面临的情形刺激 ，热刺激反应是所有细胞普遍具有的刺激反应机制 。热刺激诱导的普遍的转录调控是热刺激反应的主要组成部分 。近年来 ，人们已经从表观遗传学的各层面临其机制举行了较深入探讨 。然而目今针对染色质空间构象这一主要的表观遗传学条理 ，是否在热刺激反应中施展作用 ，以及可能的详细作用形式 ，仍然保存较大争议 。别的 ，目今针对动物细胞热刺激反应模式的研究普遍接纳急性刺激（刺激时长普遍在1小时内） ，对慢性刺激的研究也较欠缺 。
克日 ，4001老百汇网站（国家生物信息中心）张治华课题组在Genome Research杂志在线揭晓了题为“Cell cycle arrest explains the observed bulk 3D genomic alterations in response to long-term heat shock in K562 cells”的研究效果 ，对上述两个问题举行了探讨 。该研究以常见的人类K562细胞系为实验质料 ，使用Hi-C和ATAC-seq等手艺测定了其在急性和慢性热刺激反应前后的染色质空间构象和开放性图谱 。通过比照发明热刺激反应中细胞染色质空间构象和开放性水平的转变模式与细胞周期中G1/S时期向G2/M时期迁徙时的转变模式有高度相似性 。这一发明促使作者进一步研究热刺激反应中的结构转变与细胞周期的关系 。通过流式细胞分选证实了K562细胞热刺激反应中保存细胞周期于G2/M时期的阻滞 ，同时测得位于G1/S和G2/M时期的细胞染色质构象均在热刺激反应全历程中维持稳固 。最后 ，通过以G1/S和G2/M时期细胞染色质构象为组份 ，细胞集群的染色质构象为目的的解卷积运算证实晰此细胞周期阻滞引起的细胞组份改变自己便足以诠释测得的细胞集群在热刺激反应历程中染色质构象的改变 。
本研究指出的细胞周期阻滞在诠释K562细胞热刺激反应中染色质构象转变所起的要害作用不但有助于弥合目今有关热刺激反应中染色质空间构象调控模式的争论 ，也有助于增进人们对染色质空间构象在普遍且迅速的基因表达调控中所起作用的熟悉 。
本研究以4001老百汇网站（国家生物信息中心）张治华研究员为通讯作者 ，博士研究生徐炳祥和助理研究员李飞飞为并列通讯作者 ，徐炳祥和硕士研究生高晓萌为并列第一作者 。
细胞周期阻滞诠释K562细胞热刺激反应中染色质空间构象的转变
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