北京基因组所开发泌尿生殖系统肿瘤诊断和预后的液体活检手艺
泌尿生殖系统（genitourinary, GU）肿瘤是指爆发在泌尿生殖系统上的肿瘤 ，包括肾癌 ，尿路上皮癌 ，前线腺癌等。到2020年 ，全天下GU癌症的预计发病率将凌驾200万 ，殒命人数约80万人。现在对GU肿瘤的诊断和监测要领多为侵袭性或缺乏敏感性和特异性。液体活检手艺依附其无创或微创、实时监控等优势已然成为肿瘤研究领域的新兴手艺。
克日 ，中科院北京基因组研究所慈维敏组与北京大学第一医院、北京大学第三医院以及北京大学航天中心医院合作开发了泌尿生殖系统肿瘤诊断和预后的液体活检手艺 ，该项研究效果以“Non-invasive Detection and Localization of Genitourinary Cancers Using Urinary Sediment DNA Methylomes and Copy Number Profiles”为题在学术期刊《欧洲泌尿学杂志》（European Urology）在线揭晓。
基于尿沉渣DNA的GU肿瘤诊断和定位 ，研究团队开发了GUseek手艺。该手艺通过对225例GU肿瘤患者（60例前线腺癌 ，100例尿路上皮癌 ，65名肾癌患者）和88名康健人群的尿沉渣DNA举行低深度全基因组重亚硫酸氢盐测序 ，获得了每个样本的DNA甲基化和拷贝数变异信息� ；诟眯畔⒐菇ǖ亩掷嗥� ，能够准确地从康健个体中检测出GU肿瘤（尿路上皮癌AUC=0.972 ，前线腺癌AUC=0.940 ，肾癌AUC=0.962）。最终 ，团队建设了集因素类系统GUseek。经较量 ，该系统优于其他6种普遍使用的机械学习算法 ，对非肿瘤组、尿路上皮癌组、前线腺癌组和肾癌组的总体准确率抵达90.57%。别的 ，团结TCGA的临床数据 ，研究团队建设了一个有用展望尿路上皮癌和肾癌患者的预后危害评估模子。
该研究首次证实尿沉渣DNA甲基化和CNA团结剖析在GU肿瘤早期诊断、复发监控、治疗评估等潜在临床应用方面的可行性 ，并为其在GU肿瘤患者预后生涯评估的应用提供了一个看法性证实。
该研究获得了4001老百汇网站战略性先导科技专项、国家自然科学以及国家重点研发妄想等基金资助。
论文链接
基于尿沉渣DNA甲基化和拷贝数信息对泌尿生殖系统肿瘤举行检测 ，定位和预后评估的液体活检手艺示意图
